Informace o projektu
Modul pro správu a integraci proteomických dat z hmotnostních spektrometrů (ProDIK)

Informace

Projekt nespadá pod Přírodovědeckou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.
Kód projektu
MUNI/71/13287/2025
Období řešení
11/2025 - 12/2026
Investor / Programový rámec / typ projektu
Masarykova univerzita
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut

Výstupem minizáměru bude softwarový balík (ProDIK), který umožní standardizovaný přenos, primární zpracování a vizualizaci proteomických dat získaných pomocí hmotnostních spektrometrů (MS). Software bude obsahovat:

  • Specifikaci metadat pro MS data dle zavedených mezinárodních standardů EU: SDRF (Sample and Data Relationship Format), PSI-MS CV (Controlled Vocabulary) a mzQC (Mass Spectrometry Quality Control).
  • Uživatelsky přívětivé grafické rozhraní (GUI) pro zadávání, editaci a správu metadat s možností propojení na centrální omický repozitář skrze plánované API.
  • Backend aplikace pro automatizované nahrávání samotných proteomických dat ze zařízení MS do zabezpečeného prostředí repozitáře, včetně „on the fly“ kontroly kvality dat (QC) a jejich následného uložení spolu s daty ve formě metadat.
  • Integraci skriptu generujícího QC metadata přímo do frontendového GUI, což umožní zpětnou editaci, verifikaci a správu kvality dat již během nahrávání, a současně nabídne uživatelům možnost manuální kontroly a doplnění těchto metadat ještě před uložením do repozitáře.


Software umožní uživatelům jednoduše integrovat proteomická data do vznikajících omických repozitářů.

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.