Molekulární modelování a bioinformatika

Články

• Acridine-Based Chalcone 1C and ABC Transporters

  FRANKO Ondrej CIZMARIKOVA Martina KELLO Martin MICHALKOVA Radka WESOLOWSKA Olga SRODA-POMIANEK Kamila MARQUES Sérgio Manuel BEDNÁŘ David HAZIKOVA Viktoria LISKA Tomas Jan HABALOVA Viera

  Článek v odborném periodiku

  International Journal of Molecular Sciences, rok: 2025, ročník: 26, vydání: 9, DOI

• Anticipating protein evolution with successor sequence predictor

  KHAN Rayyan Tariq KOHOUT Pavel MUSIL Miloš ROSINSKA Monika DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2025, ročník: 17, vydání: 1, DOI

• Automated Engineering Protein Dynamics via Loop Grafting: Improving Renilla Luciferase Catalysis

  PLANAS IGLESIAS Joan MAJEROVÁ Marika PLUSKAL Daniel VAŠINA Michal DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk MAREK Martin BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2025, ročník: 15, vydání: 4, DOI

• Caver Web 2.0: analysis of tunnels and ligand transport in dynamic ensembles of proteins

  MARQUES Sérgio Manuel BORKO Simeon VÁVRA Ondřej DVORSKÝ Jan KOHOUT Petr KABOUREK Petr HEJTMÁNEK Lukáš DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2025, ročník: 53, vydání: May 2025, DOI

• Engineering Dehalogenase Enzymes Using Variational Autoencoder-Generated Latent Spaces and Microfluidics

  KOHOUT Pavel VAŠINA Michal MAJEROVÁ Marika NOVÁKOVÁ Veronika DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin PROKOP Zbyněk MAZURENKO Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  JACS AU, rok: 2025, ročník: 5, vydání: 2, DOI

• Increased thermal stability of FGF10 leads to ectopic signaling during development

  CZYREK Aleksandra Anna BARAN Karolina HRUBÁ Eva HORACKOVA Aneta BOSÁKOVÁ Veronika CHUDZIAN Julia FAFÍLEK Bohumil LASKOVA Veronika STEPANKOVA Veronika BEDNÁŘ David KARL Kelly KASPAREK Petr BOSÁKOVÁ Michaela KILLINGER Michal SZOTKOWSKA Tereza PROCHAZKA Jan ZIEBA Jennifer T RICO LLANOS Gustavo FRIČ Jan HADZIC Stefan LOKU Edma WUJAK Magdalena SVOZILOVÁ Kateřina STROBLOVÁ Michaela SEDLACEK Radislav HRISTOVA Kalina KRAKOW Deborah KUBOVCIAK Jan DELATTRE Mathys BARTOSZEWSKI Rafal BUCHTOVÁ Marcela KROWARSCH Daniel CHALOUPKOVÁ Radka ZAKRZEWSKA Malgorzata KREJČÍ Pavel

  Článek v odborném periodiku

  Cellular and molecular life sciences, rok: 2025, ročník: 82, vydání: 1, DOI

• Visual Support for the Loop Grafting Workflow on Proteins

  OPÁLENÝ Filip ULBRICH Pavol PLANAS IGLESIAS Joan BYŠKA Jan ŠTOURAČ Jan BEDNÁŘ David FURMANOVÁ Katarína KOZLÍKOVÁ Barbora

  Článek v odborném periodiku

  IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, rok: 2025, ročník: 31, vydání: 1, DOI